তৃণমূলে ছাপ পড়েছে গোষ্ঠীদ্বন্দ্বের। তবে বর্তমানে অভ্যন্তরীণ পরিস্থিতি তুলে ধরছে, যেখানে গোষ্ঠীদ্বন্দ্ব ও স্থানীয় নেতাদের মধ্যে বিবাদ দলের নির্বাচনী ফলাফলে নেতিবাচক প্রভাব ফেলেছে। দলের দ্বিতীয় কমান্ডো অভিষেক বন্দ্যোপাধ্যায়ের পাঠানো রিপোর্টে যেমন উঠে এসেছে, দলের কিছু নেতা ও কর্মীদের মধ্যে সমন্বয়হীনতার কারণে স্থানীয় স্তরে অনেক জায়গায় অল্প ব্যবধানে পরাজয় হয়েছে, যার মধ্যে উল্লেখযোগ্য আসনগুলো হলো বিষ্ণুপুর, পুরুলিয়া, এবং বালুরঘাট।
এছাড়া, ওই রিপোর্টে এমন কিছু অভ্যন্তরীণ সমস্যা উঠে এসেছে যা দলের শৃঙ্খলাবদ্ধতা ও প্রভাবিত অঞ্চলে দলের ক্ষমতা কমতে পারে। পুরসভা স্তরের কোন্দল ও বুথ কমিটির মধ্যে গোষ্ঠী দ্বন্দ্বের ফলেও দল অস্বস্তিতে পড়েছে।
এই পরিস্থিতি মোকাবিলায়, অভিষেক বন্দ্যোপাধ্যায় মমতা বন্দ্যোপাধ্যায়কে দ্রুত ব্যবস্থা নিতে এবং গোষ্ঠীদ্বন্দ্ব দমন করতে সুপারিশ করেছেন। দলের মধ্যে কঠোর পদক্ষেপ নিতে বলা হয়েছে, যাতে ভবিষ্যতে এমন পরিস্থিতি আর না হয়। রাজনৈতিক মহলে ধারণা করা হচ্ছে, উপনির্বাচনের পর তৃণমূল কংগ্রেসের সংগঠন ও নেতৃত্বে বড়সড় রদবদল হতে পারে।
